El 8 de julio del 2004, el FC Barcelona se hermanaba con el CN
Barcelona. Y firmaban un acuerdo de colaboración mediante el cual ambas
entidades iniciaban una cooperación a nivel institucional, social,
deportivo y cultural. El hermanamiento lo rubricaron los dos
presidentes, Joan Laporta, por parte del FC Barcelona, y Sebastià
Millans, por parte del CN Barcelona. El acuerdo, de un año de duración,
permitiría que las dos instituciones intercambiasen experiencias en el
ámbito de la medicina, la gestión deportiva y el fomento del deporte
catalán. Además, se promoverán actividades para fomentar la cultura de
la paz y la convivenciaLaporta destacó que "las dos entidades fueron pioneras en el deporte catalán de principios del siglo XX, pues se fundaron en el Gimnasio Solé, y ambas han logrado importantes éxitos y siempre han coincidido en la defensa de valores como el catalanismo y el civismo". Recordó que destacados socios del FC Barcelona, caso de su fundador, Joan Gamper, Armand Carabén o Ernest Lluch también lo fueron del Club Natació Barcelona. Por su parte, Millans comentó que "de nuestros 9.600 socios, el 85% lo son también del FC Barcelona, y los dos clubs llevan el nombre de nuestra querida ciudad".
El CN Barcelona durante muchos años coincido en los colores en su sección de atletismo, que ha contado con granses atletas en la Marcha atlerica Josep Marín, Valentí Massana, Mari Cruz Díaz, Reyes Sobrino, María Vasco o David Márquez